Altérations du microbiote intestinal en biopsie
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Altérations du microbiote intestinal en biopsie

Jun 15, 2023

Rapports scientifiques volume 13, Numéro d'article : 12150 (2023) Citer cet article

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Le microbiote intestinal est étroitement lié aux maladies parentérales non transmissibles via l’immunité intestinale et joue un rôle important dans la survenue du diabète et de la néphropathie diabétique. Le but de l'étude était de comprendre l'axe intestin-rein par une analyse de la composition du microbiote intestinal chez des patients atteints de néphropathie diabétique (DN) prouvée par biopsie, des patients atteints de diabète de type 2 depuis plus de 10 ans sans lésion rénale (DM) et contrôles sains (NC). Trente-cinq patients DN, 40 patients DM et 40 sujets sains appariés par âge et sexe ont été recrutés entre janvier 2022 et décembre 2022. Des informations de base et des paramètres cliniques ont été collectés. Le séquençage de l’ADNr 16S a été réalisé pour caractériser le microbiome intestinal et identifier les microbes intestinaux qui étaient différemment abondants entre les patients et les témoins sains. La relation entre l'abondance relative de taxons bactériens spécifiques dans l'intestin et le phénotype clinique et les indicateurs pathologiques a été évaluée. Des différences substantielles ont été trouvées dans la richesse du microbiote intestinal et la variation de la population bactérienne parmi les patients DN, les patients DM et les témoins sains. Les patients atteints de diabète ont pu être distingués avec précision des témoins sains du même âge et du même sexe grâce aux variations de g_Clostridium-XVIII (AUC = 0,929), et les patients DN ont pu être distingués avec précision des témoins sains du même âge et du même sexe grâce aux variations de g_Gemmiger (AUC = 0,929). 0,842). Les patients DN ont pu être distingués avec précision des patients atteints de diabète de même âge et sexe grâce aux variations de g_Flavonifractor ou de g_Eisenbergiella (ASC = 0,909 et 0,886, respectivement). Le microbiote intestinal était également étroitement lié aux phénotypes cliniques et aux indicateurs pathologiques. L’étude de la composition du microbiote intestinal a été explorée pour déterminer sa relation avec l’apparition de DN et une longue histoire de diabète sans lésion rénale. La progression pathologique rénale de la DN peut être retardée en régulant les modifications du microbiote intestinal.

Avec la prévalence croissante du diabète, le nombre de patients atteints de néphropathie diabétique (DN) a également augmenté de manière significative. Les résultats d'une enquête épidémiologique en Chine de 2015 à 2017 ont montré que la prévalence du diabète chez les adultes était de 11,2 %1. En tant que complication microvasculaire grave du diabète, la DN est devenue la principale cause d'insuffisance rénale terminale (IRT) dans le monde2,3,4. Il existe environ 500 à 1 000 espèces de bactéries dans le tractus gastro-intestinal humain, avec un nombre de 1 014 UFC, qui sont clairement appelées « organes » acquis5. Ils aident l'hôte à maintenir des fonctions physiologiques normales, notamment l'absorption d'énergie, la production de vitamines et de molécules actives de base, l'antagonisme biologique, la régulation immunitaire. Sa composition et son nombre ont maintenu un équilibre dynamique avec l'hôte en évolution6. Un grand nombre d’études ont montré que le microbiote intestinal peut participer à l’apparition et au développement de maladies en régulant le métabolisme énergétique de l’hôte, la réponse inflammatoire systémique et la sécrétion d’hormones intestinales. Le microbiote intestinal joue également un rôle important dans diverses maladies rénales, et les endotoxines, les protéines et certains métabolites qu’ils produisent ont certains effets sur le rein via l’axe intestin-rein7. En observant le microbiote intestinal de patients atteints de néphropathie diabétique confirmée par biopsie rénale et de patients atteints de diabète de longue durée sans lésion rénale, cette étude visait à explorer le schéma de déséquilibre et les changements fonctionnels dans les deux états pathologiques et à établir un modèle d'algorithme de classification pour distinguer les deux par le microbiote intestinal. Nous explorons également la corrélation entre le microbiote intestinal et les phénotypes cliniques et indices pathologiques.

L'étude rétrospective a inclus 35 patients atteints de néphropathie diabétique confirmée par biopsie rénale, 40 patients atteints de diabète de type 2 depuis plus de 10 ans sans lésion rénale et 40 sujets sains appariés par âge et sexe. Nous avons recruté des patients et des témoins sains à l'hôpital populaire de la province du Shanxi entre janvier 2022 et décembre 2022. Dans le groupe DN, les critères d'inclusion étaient les suivants :

 0.9. All heatmaps were visualized by the package pheatmap (version 1.0.12). The clinical data of patients with DN and DM and healthy controls were expressed as the mean ± SD or median, and the numerical data were expressed as percentages. A t test or nonparametric test was used to compare continuous variables. Chi-square tests were used to compare categorical variables. The statistical analysis was performed using SPSS version 26.0./p> 0.05) (Fig. 1b). Principal coordinates analysis (PCoA) based on Bray–Curtis dissimilarity at the OTU level showed that the microbiota compositions of NC, DM, and DN patients were significantly different, as shown in Fig. 1c (P = 2.569e−16). The fecal microbiota of patients with DM and DN and the NC subjects was clearly separated along PCoA2 and PCoA1, which explained 11.58% and 12.93% of the total variation, respectively. Together, these data suggest that the fecal microbial structure was significantly altered in patients with DM and DN compared to that in NC subjects in the presence of OTUs./p> 3) and effect size (LEfSe) analysis revealed significant differences (P < 0.05) in the fecal microbiota exhibited by the DM (reg score),DN(green score) and NC (blue score) groups. (b) This analyse revealed the most differentially abundant taxa at the genus level of bacterial between DM (yellow),DN (blue) and NC (red) groups. *P + 0.05 + **P + 0.01./p>